Indonesia merupakan negara yang kaya dengan keanekaragaman hayatinya. terdapat lebih dari 30.000 jenis yang telah diidentifikasikan dan 950 spesies diantaranya diketahui memiliki fungsi biofarmaka, yaitu hewan, tumbuhan dan mikroba yang memiliki potensi sebagai obat, makanan kesehatan nutraceutilcals, baik untuk manusia, hewan maupun tumbuhan. Dengan kekayaan akan spesies dengan fungsi biofarmaka ini maka negara Indonesia memiliki peluang yang sangat besar untuk menjadi salah satu negara terbesar dalam industri obat dan kosmetika berbahan baku tumbuh-tumbuhan yang memiliki peluang pasar yang cukup besar pula.
Dalam Akuakultur (Budidaya Perikanan) fitofarmaka juga berperan sangat penting, khususnya untuk mengobati penyakit pada ikan dan menjaga stabilitas lingkungan perairan dimana ikan yang sakit itu diobati, ilmu ini masih bisa dikatakan baru di dalam dunia Akuakultur, sehingga penerapannya secara terus menerus diharapkan Fitofarmaka ini digunakan sebagai obat yang penggunaannya lebih aman dan menjadi pengganti untuk obat-obatan kimia yang memiliki efek samping, dan juga residu yang berbahaya bagi lingkungan maupun manusia yang mengkonsumsi ikan tersebut.